长江刀鲚体内菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性比较分析

• 作 者: 聂志娟 徐钢春 程起群 杜富宽 张勇 顾若波 朱文龙
• 机 构: 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院东海水产研究所,南京农业大学渔业学院,江阴市周庄镇农服中心
• 出 处: 水生生物学报
• 发表日期: 2015年5期
• 关键词: PCR-DGGE 长江刀鲚 洄游 香农指数 细菌菌落 PCR-DGGE Coilia nasus Migration Shannon index Bac
• 基金项目: 公益性行业科研专项（No.201203065）,国家科技支撑计划项目（No.2012BAD26805）,中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目（No.2013JBFT04）,农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室开放课题资助

以长江刀鲚（Coilia nasus）洄游前幼鱼和洄游后成鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术探讨长江刀鲚菌群多样性及受洄游路径周围环境影响之后的稳定性。结果显示,PCR-DGGE指纹谱带丰富,共显示出70条可鉴别条带,其中长江水体谱带数（28）高于洄游后刀鲚鳃（26）、胃（26）、肠道壁（20）、肠道内容物（21）和洄游前刀鲚鳃（21）、胃（20）、肠道壁（11）、肠道内容物（13）,洄游后刀鲚成鱼体内各对应部位菌群数显著高于洄游前刀鲚幼鱼。UPGMA聚类和PCA结果显示不同样品之间差异显著,虽长江水