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磷钙土被广泛用于生产肥料的原料或直接用作肥料。对它的研究非常深入，包括分析微量元素组分。发现沉积岩中微量元素的一般分面规律和从磷钙土的实际农业化学应用观点出发是很重要的，因为在其组分中的部分微量元素是微量肥料，而部分（例如铀）则在生态上是危险的。磷钙土是获得铀的重要矿石，美国大部分铀正是从磷钙土中获取的。