【摘 要】
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利用已完成的金针菇(Flammulina filiformis)基因组数据,通过构建HMM模型、鉴定氨基酸序列保守结构域得到金针菇基因组中87个Zn2Cys6型锌指转录因子家族成员(命名为FfZCP01～FfZCP87).通过分析锌簇结构域,将87个家族成员分为13个类型(A～M),并且发现不同类型的家族成员虽然具有相似的基序模式,但氨基酸保守程度不同;进化水平分析显示A～D、F类型内的成员间亲缘关系较近.选取8个FfZCP家族主要类型的典型基因进行实时荧光定量PCR,结果发现FfZCP09、FfZCP2
【机 构】
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福建农林大学生命科学学院菌物研究中心,福建福州350002;福建农林大学生命科学学院菌物研究中心,福建福州350002;福建农林大学园艺学院,福建福州350002
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利用已完成的金针菇(Flammulina filiformis)基因组数据,通过构建HMM模型、鉴定氨基酸序列保守结构域得到金针菇基因组中87个Zn2Cys6型锌指转录因子家族成员(命名为FfZCP01～FfZCP87).通过分析锌簇结构域,将87个家族成员分为13个类型(A～M),并且发现不同类型的家族成员虽然具有相似的基序模式,但氨基酸保守程度不同;进化水平分析显示A～D、F类型内的成员间亲缘关系较近.选取8个FfZCP家族主要类型的典型基因进行实时荧光定量PCR,结果发现FfZCP09、FfZCP28、FfZCP32、FfZCP60、FfZCP62基因在蓝光照射下表达量显著下调,推测其可能以负调控方式参与金针菇对蓝光照射的响应过程,结果为进一步揭示蓝光对金针菇的作用机制提供参考.
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