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组织工程中刺激因子的作用是诱导、加速或，和增强软骨形成。生长因子与其添加物加入体外培养介质中或加入支架中体内递送以控制细胞分化和组织形成。目前，许多生长因子以及其他可溶性因子如透明质酸、硫酸软骨素和胰岛素已开始被单一地或协同地应用于软骨组织工程，其作用效果依赖于细胞的类型和培养条件。基因治疗利用过分表达的生物活性分子作用于细胞是另一种局部转导的方法。另一种刺激因子是调节负载方式的机械信号，如流体静压和动态压力或通过生物反应器。目前应用于软骨组织工程中的生物反应器包括：平行平板生物反应器、旋转壁式生物反应器