拟南芥和水稻CesA基因家族的生物信息学分析

• 作 者: 王振怡 王金朋 潘玉欣 张家琦 王希胤
• 机 构: 河北联合大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心
• 出 处: 河南农业科学
• 发表日期: 2015年6期
• 关键词: 纤维素合成酶基因 拟南芥 水稻 生物信息学 基因表达
• 基金项目: 国家自然科学基金项目(31170212);河北省教育厅项目(Y2012025);河北省科学技术厅项目(14962905D);河北联合大学自然科学研究基金项目(z201235,z201230)

以拟南芥和水稻21个纤维素合成酶基因（ CesA）为研究对象,对其基因结构、保守结构域、蛋白质跨膜结构、亚细胞定位、基因表达等进行综合分析。结果显示,CesA基因长度在3.5~6.5 kb,有7~13个内含子（ OsCesA10除外）。 CesA基因编码的蛋白质保守性较强,含有该基因家族的保守结构域Ring finger（ OsCesA10、OsCesA11除外）和Cellulose synthase。水稻和拟南芥的CesA蛋白跨膜螺旋数量为6个或8个（ OsCesA10除外）。蛋白质亚细胞定位结果表明,