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某军队医院绩效评估指标体系的运行和绩效管理工作的改进，切实调动了医务人员积极性，并促进医院目标的实现；同时存在一些问题，如存在不作为指标、评分标准不明确、临床科室按绩效分考评对科室超劳影响有限等。医院对绩效评估指标体系进行周期性修改，增加重要效率、质量指标，明确指标评分标准，并提高超劳补助中绩效奖占比；军队医院绩效评估指标体系仍需灵活修改，提高评估指标可操作性，注重反应性等公益性指标，依托信息化提高评估效率。