荷包猪一类缺失型SLA-3等位基因的克隆及生物信息学分析

• 作 者: 乔翠 许崇波 张兴会 张文军 郭丹 张胜 高凤山
• 机 构: 大连大学生物工程学院生物化学和分子生物学实验室,辽宁省畜牧科学研究院
• 出 处: 生物技术通报
• 发表日期: 2012年9期
• 关键词: 荷包猪 SLA-3基因 缺失型 等位基因 生物信息学 Hebao pig SLA-3 gene Deleted-type Allele Bioinformati
• 基金项目: 国家自然科学基金项目（30972169）, 辽宁省博士启动基金（20081078）, 辽宁省教育厅科学计划项目（L2010018）

为研究荷包猪SLA-3基因特征,设计引物克隆了荷包猪SLA-3,经生物信息学软件分析其基因特征。结果显示,所克隆的荷包猪SLA-3基因（暂命名为SLA-3-HB02）碱基序列长度为1 417 bp,其中2-1 054为ORF区,共编码350个氨基酸,在其编码的氨基酸334-344处存在缺失。SLA-3-HB02与其他SLA-3、SLA-2及SLA-1等位基因群的氨基酸同源率分别为87.8%-98.6%、82.8%-87.8%和83.7%-90.0%。分子进化关系分析,SLA-3-HB02与美国的Hanfo