【摘 要】
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目的 对2018年深圳市龙华区发生的一起由诺如病毒GⅠ.5型引起的胃肠炎聚集性疫情进行分子流行病分析.方法 对诺如病毒GⅠ组核酸阳性的样本进行聚合酶-衣壳区序列测定,同源性
【机 构】
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深圳市龙华区疾病预防控制中心,公共卫生应急检测重点实验室,传染病预防控制重点实验室,广东深圳518109;深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所,广东深圳,518000
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目的 对2018年深圳市龙华区发生的一起由诺如病毒GⅠ.5型引起的胃肠炎聚集性疫情进行分子流行病分析.方法 对诺如病毒GⅠ组核酸阳性的样本进行聚合酶-衣壳区序列测定,同源性和系统进化分析.结果 成功获得3份样本的聚合酶-衣壳区序列,样本编号分别为18JB00186、18JB00187和18JB00190,长度552 bp,核苷酸和氨基酸的同源性为100％,与2018年成都分离株MK121731.1同源性最高,相似度(Per.Ident)99.07％.衣壳区的系统发生树构建分析结果显示,它们属于GⅠ.5进化分支,与2013年济南、2014年上海和2018年成都的部分分离株同属于一个进化分支,为GⅠ.5.1分支.聚合酶区的系统发生树构建分析结果显示,它们属于GⅠ.P4进化分支.结论 应进一步加强辖区诺如病毒不同型别监测,持续关注不常见型别进化情况.
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