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目的
探索肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)相关基因的表达对患者预后的影响及潜在的作用机制。
方法下载TCGA数据库level3水平下的RNASeq V2数据，利用外显子read count来计算基因的表达。构建差异共表达的基因互作网络，从中提取最大组分。利用CFinder搜索子网。结合多变量Cox风险回归模型和Kaplan-Meier(K-M)生存分析来识别HCC患者预后的相关基因。通过KEGG通路映射来分析相关基因潜在的作用机制。
结果识别了17个HCC患者预后相关基因，其中只有FGF9同时参与模块15和模块22两个相关子网(P＝5.86E-06，P＝1.74E-06)。FGF9恰好处于MAPK信号通路的起始位置，其表达能影响下游Ras信号的传递，进而对细胞的增殖和分化产生影响。
结论基因FGF9表达的失调可能会通过影响细胞的增殖和分化功能来影响肝细胞癌患者预后。