预测结直肠癌预后免疫相关基因对标志模型的构建及验证

来源 :中国普通外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shanxiaoqqqq
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的:结直肠癌(CRC)是一种诊断较晚、预后较差的侵袭性疾病.越来越多的证据表明CRC与免疫标志之间存在密切的相关性.本研究旨在建立用以预测CRC患者预后的免疫相关基因对(IRGP)标志.方法:从TCGA和GEO数据库下载CRC患者的基因表达谱及临床信息,分为一个训练数据集(TCGA-COAD)和一个验证数据集(GSE39582).从ImmPort数据库中下载免疫相关基因(IRG),用于训练数据集及验证数据集中IRG的筛选.对每一个样本中IRG的表达值进行成对的比较,运用Lasso-Cox比例风险模型迭代1 000次来构建最终IRGP标志[免疫基因对指数(IRGPI)].利用IRGP标志的ROC曲线将CRC患者分为高风险和低风险组,并且使用Kaplan-Meier法及Log-Rank检验分析两组患者的生存状态.同时,使用单因素及多因素的Cox比例风险回归模型分析评估了此标志的预测能力.随后,应用CIBERSORT对肿瘤样品进行去卷积算法,明确CRC患者的免疫细胞浸润情况.最后,对模型进行了功能注释及分析,用以进一步了解模型的相关生物学功能.结果:成功构建了20个由28个不同的IRG组成的IRGPI(CXCL14|BST2,RBP1|STC2,RBP7|PTGS2,RBP7|ARG2,RBP7|IL7,APOD|IL17RB,GNAI1|GRP,CCL4|INHBB,CCL28|INHBB,ABCC4|GRP,ARG2|GRP,CCR7|INHBB,CD86|IL7,OLR1|IL7,C5AR1|NR3C2,INHBB|PDGFC,STC2|HNF4G,IL10RA|TNFRSF11A,RORC|PRKCQ,TNFRSF11A|LCK),这些标志与CRC患者的预后明显相关.在训练数据集中,高风险组的CRC患者总生存率明显差于低风险组的CRC患者(P=1.295×10-11,HR=6.51,95%CI=3.79~11.21),在验证数据集中得到的验证结果与之相同(P=0.000 1,HR=1.82,95%CI=1.36~2.44).单因素和多因素Cox分析显示,IRGPI是CRC 的独立预后因素(训练数据集:HR=3.270,95%CI=2.555~4.186,P<0.001、HR=3.008,95%CI=2.295~3.941,P<0.001;验证数据集:HR=1.278,95%CI=1.107~1.474,P<0.001、HR=1.189,95%CI=1.024~1.380,P=0.023).根据免疫细胞浸润分析显示,相比较低风险组而言,高风险组中调节性T细胞(P=0.007),巨噬细胞(P=0.024)含量明显更高,而静息树突状细胞(P=0.006),静息CD4+记忆T细胞(P=1.784×10e-05)在低风险组中的含量更为显著.功能注释结果显示,IRG与一些生物过程有关,包括白细胞迁徙,细胞趋化性,细胞因子-细胞因子-受体相互作用等.而在高-低风险组间存在显著差异的相关通路有:角化细胞分化、角化、表皮细胞分化、皮肤发育等过程.结论:本研究成功构建了可以预测CRC患者预后的IRGP标志,从而为CRC的诊断及相关治疗提供了新的思路.
其他文献
腹腔镜胃癌根治手术自开创至今已经历20余年的发展,随着微创外科理念的不断深入及腹腔镜器械的不断革新,腹腔镜胃癌手术在世界范围已广泛开展.我国虽起步较晚,也取得了长足进
目的 调查丽江市古城区野鼠鼠疫疫源地宿主动物携带鼠疫噬菌体情况,并探讨其流行病学意义,为野鼠鼠疫疫源地宿主动物的防制提供科学依据.方法 2017年9月于丽江市古城区5个乡
背景与目的:腹股沟疝修补术是日间病房最常见的手术之一.随着现代腹股沟疝手术和麻醉技术的发展,越来越多的腹股沟疝手术可以在日间病房完成.然而,对于日间腹股沟疝手术方式
开放腹膜前修补术(sublay)和腹腔镜腹腔内修补术(IPOM)是治疗腹壁切口疝的主要术式,各类腔镜非腹腔内修补术(MINIM)目前处于探索阶段,未来有较大的进展空间.IPOM和MINIM术式
目的:观察柴胡疏肝散联合孟鲁司特纳治疗胸闷变异性哮喘肝郁气滞证的临床疗效.方法:将42例胸闷变异性哮喘肝郁气滞患者按随机数字法分为对照组和治疗组各21例,对照组口服孟鲁
【摘 要】 目的:观察中西医结合治疗高血压性眩晕患者的临床疗效。方法:选取62例高血压性眩晕患者作为研究对象,随机分成对照组和观察组各31例,对照组给予马来酸左旋氨氯地平治疗;观察组在对照组基础上加服复方恒清汤。两组均治疗6周,治疗后对比症状改善效果、空腹血糖(FBG)及血脂水平,记录治疗期间不良反应发生情况。结果:两组治疗6周后,DARS积分和症状积分均较治疗前降低,且观察组降低幅度高于对照组(
目的:观察自拟补气通秘方加减治疗气阴两虚证老年便秘的临床疗效及对患者血清SP、VIP和NO水平的影响.方法:将50例老年患者且诊断为气阴两虚证者随机分为对照组和观察组,每组2
背景与目的:脐疝是较常见的腹壁疝之一,手术治疗是其唯一可治愈的治疗方法.随着腔镜技术的发展,腔镜在疝与腹壁外科的应用不断深入.本文旨在探讨经侧方入路腹腔镜下完全腹膜
背景与目的:造口旁疝(PSH)是造口术后常见并发症,存在发生率高及修复困难等特点.为此,有研究提出在造口术时应用预防性补片加强腹壁的方法来减少这一并发症.然而,最近的几项
背景与目的:CXC趋化因子配体14(CXCL14)是一种与肿瘤细胞迁移密切相关的趋化因子,与多种恶性肿瘤的发生、进展有关.本研究旨在探讨CXCL14在结直肠癌细胞中的表达以及对血管生