【摘 要】
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通过测定盐胁迫下沙棘生理指标的变化,利用生物信息学方法分析沙棘在盐胁迫下转录组数据,挖掘沙棘盐胁迫下差异表达基因,为沙棘在土壤盐渍化区域的开发及其利用提供理论依据
【机 构】
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新疆农业大学林学与园艺学院,阿克苏地区林业科学研究所,
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通过测定盐胁迫下沙棘生理指标的变化,利用生物信息学方法分析沙棘在盐胁迫下转录组数据,挖掘沙棘盐胁迫下差异表达基因,为沙棘在土壤盐渍化区域的开发及其利用提供理论依据。生理指标测定结果表明,在300mmol/L的盐胁迫下,丙二醛含量呈平稳上升的趋势。分析300mmol/L NaCl胁迫14d的沙棘叶片与对照总RNA,发现差异表达基因富集在光合作用、光合生物固碳、丙酮酸代谢、苯丙醇合成、乙醛酸盐代谢及丝氨酸、甘氨酸和苏氨酸代谢通路这6大通路中。其中,与光合作用通路相关的差异表达基因达到了27个,是所有代理通路中差异表达基因最多的。在gene ontology(GO)功能数据库中,差异表达基因主要富集在催化活性、氧化还原过程和氧化还原酶活性三大功能中。由于光合作用的影响,造成丙酮酸、苯丙醇、乙醛酸和氨基酸代谢的差异,有可能是沙棘抗盐胁迫的重要原因。
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