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目的了解贵阳地区引起手足口病（HFMD）的非肠道病毒71型（EV71）、非柯萨奇病毒A（CVA）16型肠道病毒的病原构成及优势型别,为贵阳地区HFMD防治工作提供依据。方法收集2013年4~6月检测为非EV71、非CVA16型肠道病毒的HFMD患者肛拭子标本共107例。提取病毒核酸,用巢式RT-PCR法扩增病毒VP4区序列,对PCR阳性扩增产物进行测序,通过与GenBank收录的序列BLAST比对确定病毒型别;并对优势型别进行序列和进化分析。结果 107例标本中共有100例标本巢式RT-PCR检测为阳性（