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以83-58×Perennial构建的包括138个单株的重组自交系(RIL)群体为作图群体,利用142个SSR标记、24个CAPS标记以及果实辣味、果柄着生方向(pun和up)2个形态标记构建遗传连锁图谱并进行了辣椒成熟果实中辣椒红素的QTL定位。生理成熟期(花后70d)辣椒果实的辣椒红素含量测定值作为QTL定位时的表型数据,利用复合区间作图法共检测到3个QTL位点,分别位于辣椒的第2、10、12条染色体上,分别解释了表型变异的7.6%、8.2%、6.5%。