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基因芯片(gene chip,microarray)作为一种新型的高通量的检测技术方法,可以同时测量成千上万个基因的表达水平,已成为"后基因组时代"研究基因与基因间相互作用的一个强有力的工具[1].如何对该技术产生的海量实验数据进行准确而合理地分析,已成为有效应用该项技术的主要瓶颈问题,并已成为当前生物信息学的重要研究内容和主要研究方向.