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目的观察小儿手足口病脑炎与病毒性脑干脑炎MRI及临床表现差异。方法对MR检查阳性的11例手足口病脑炎与17例病毒性脑干脑炎患儿的影像学及临床资料进行回顾性分析。结果手足口病脑炎和病毒性脑干脑炎常于脑干多发并对称发生，手足口病脑炎累及延髓的概率远大于病毒性脑干脑炎，而累及中脑的概率则小于后者。手足口病脑炎患儿临床表现较重，意识障碍和呼吸循环衰竭的发生率较病毒性脑干脑炎高，常合并单侧或双侧肢体急性迟缓性麻痹。结论小儿手足口病脑炎与病毒性脑干脑炎在好发部位及临床表现上存在一定差异。MRI可为临床鉴别诊断、制定治