【摘 要】
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目的 基于网络药理学和生物信息学方法初步探讨选择性环氧化酶-2(COX-2)抑制剂塞来昔布治疗腺性膀胱炎(CG)的作用靶点及分子机制.方法 利用PubChem等数据库获取塞来昔布化合物作用靶基因.利用GeneCards和CTD数据库分析得到的CG相关基因集合,然后筛选出与塞来昔布治疗CG的潜在靶点.利用GENEMANIA数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,应用DAVID数据库对该基因集合进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.利用分子对接技术对潜在靶点和
【机 构】
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317000 温州医科大学附属台州医院泌尿外科;317000 温州医科大学附属台州医院药剂科
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目的 基于网络药理学和生物信息学方法初步探讨选择性环氧化酶-2(COX-2)抑制剂塞来昔布治疗腺性膀胱炎(CG)的作用靶点及分子机制.方法 利用PubChem等数据库获取塞来昔布化合物作用靶基因.利用GeneCards和CTD数据库分析得到的CG相关基因集合,然后筛选出与塞来昔布治疗CG的潜在靶点.利用GENEMANIA数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,应用DAVID数据库对该基因集合进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.利用分子对接技术对潜在靶点和塞来昔布的相互作用进行验证.结果 本研究获得塞来昔布靶基因108个,利用Gene Cards和CTD数据库查询到与CG有关的基因分别为253、21964个,共筛选出塞来昔布治疗CG潜在靶点共8个,即PTGS1、PTGS2、MAPK14、CCND1、HRH1、PARP1、CDK1和RAF1.利用GENEMANIA数据库检索上述基因并构建PPI网络,得到28个节点和5种蛋白互作关系.GO富集分析发现,塞来昔布治疗CG的靶点分别富集在后随链伸长、DNA修复、细胞分裂等生物学过程,细胞核、核浆、细胞质等细胞组分,DNA连接酶活性、蛋白激酶结合、NAD+ADP核糖转移酶活性等分子功能中.KEGG信号通路富集分析发现,该基因集主要富集在碱基切除修复、催产素信号通路、血管内皮生长因子信号通路等信号通路上.分子对接结果显示,塞来昔布与其治疗CG潜在靶点之间均能较好的结合.结论 本研究通过网络药理学和生物信息学方法识别塞来昔布治疗CG相关的潜在靶点,为进一步研究塞来昔布治疗CG的作用机制提了理论依据.
其他文献
目的:探讨采用无吻合血管趾骨甲皮瓣行指尖再造术的临床效果。方法:2015年1月至2020年10月，东莞长安新安医院选择具备一定条件的指尖损伤患者，采用无吻合血管的趾骨甲皮瓣修复指尖缺损，供区创面直接缝合或皮瓣局部转移覆盖，该文对其临床资料进行了回顾性分析。采取门诊、电话、微信、登门拜访等方式随访患指外观及功能。采用中华医学会手外科学会拇手指再造功能评定试用标准对手部功能进行评定，并从4个方面对再造后甲床外观、功能进行评定。结果:共纳入11例12指。男8例，女3例，年龄17~50岁，平均35.6岁。其中压砸
脂肪干细胞(ASC)具有良好的免疫调节作用，在血管化同种异体复合组织移植、自体脂肪移植、创面愈合等修复重建领域中有潜在免疫调节应用价值。该文通过回顾相关文献，讨论了ASC的静脉注射、腹腔注射、局部注射以及外泌体注射等不同给药方式的特点及应用条件，为ASC免疫调节进一步应用提供参考。“,”Since adipose stem cells (ASC) have a good immunomodulatory capacity, ASCs have great potential in immunoregula
目的 探讨不同水平自噬对替莫唑胺抑制神经胶质瘤细胞增殖的影响.方法 使用0(对照)、10、25、50μg/L的雷帕霉素(RAPA)预处理人胶质瘤细胞(U87细胞)0.5 h;再加入200μmol/L替莫唑胺作用24 h,收集U87细胞.采用流式细胞术检测自噬标志物微管相关轻链蛋白3(LC3)-Ⅱ表达量,RT-PCR法检测自噬相关基因Beclin-1 mRNA相对表达量,MTT法检测细胞增殖抑制率.结果 对照组、10μg/L组、25μg/L组和50μg/L组U87细胞LC3-Ⅱ表达量、Beclin-1 mR
目的:提出一种运用上睑提肌腱膜重置的方法，来获得仿生、动态、稳定且瘢痕轻的重睑形态的新术式。方法:纳入2018年9月至2020年1月上海交通大学医学院附属第九人民医院整复外科应用“上睑提肌腱膜重置法”行切开重睑的汉族患者。以睑缘高度、睑缘弧度、重睑线弧度、切口平整度、眼睑下唇平整度、对称性、脱落率作为术后恢复评价指标，由医生和患者分别对术眼重睑形态进行综合评价，评级为满意、基本满意和不满意。结果:共纳入151例患者，其中男24例，女127例，年龄18~41岁，平均27.1岁。术后6个月随访评估：医生综合评
重睑成形术是整形外科实施较多的手术之一，随着整形外科学的不断发展，各种术式层出不穷。该文对切开法重睑术的演变发展从手术原理和手术技巧两个方面进行了综述。手术原理可分为3种，即利用与睑板或睑板前筋膜形成粘连、直接利用上睑提肌腱膜动力以及间接利用上睑提肌腱膜动力。手术技巧包括切口的设计及组织的处理。“,”Blepharoplasty is one of the most commonly performed in plastic surgery. With the continuous development
目的 探讨伊曲康唑(Itra)促进腺苷酸蛋白激酶(AMPK)磷酸化诱发结直肠癌(CRC)细胞铁死亡的抗癌机制.方法 体外培养结肠癌HCT116细胞,并将细胞分为对照组、Itra组、Itra+AMPK抑制剂组(抑制剂组)和Itra+AMPK siRNA干扰组(干扰组);采用MTT法检测细胞存活率,活死细胞染色法检测死亡细胞比例,Western blot法检测AMPK、磷酸化AMPK(p-AMPK)、胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)、xCT蛋白表达水平,流式细胞术检测细胞内活性氧(ROS)含量,Hoechst染
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