一个改进的PCR过程中聚合酶复制精确性测定系统的建立

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在大肠杆菌中建立了一套用于测定DNA聚合酶在PCR过程中复制精确性的系统,并测定了耐热FDDNA聚合酶在PCR扩增过程中的复制精确性。这一系统主要包括以质粒pUC118和pUC119为出发质粒所构建的一套共6个突变质粒,分别为pFDFP118和pFDFP119(+1移码突变)、pFDFM118和pFDFM119(-1移码突变)、pFDFU118和pFDFU119(碱基置换突变)。这些突变质粒均不能进行lacZ-α互补反应,因此在含有X-Gal和IPTG的培养基上菌落呈白色。同时还构建了PCR产物克隆载体pFDFL118和pFDFL119。以上述突变质粒为模板进行PCR反应,取反应产物和pFDFL118或pFDFL119连接后转化到大肠杆菌中。若在PCR过程中发生回复突变,则转化子在含有X-Gal和IPTG的培养基上呈蓝色。由转化子中蓝白菌落个数即可计算出DNA聚合酶的复制差错率。用这一系统测得FDDNA耐热聚合酶的复制差错率为10-5~10-6。 A set of systems for determining the accuracy of DNA polymerase in PCR was established in E. coli and the replication accuracy of the thermostable FD DNA polymerase during PCR amplification was determined. This system mainly includes a set of 6 mutated plasmids constructed from plasmid pUC118 and pUC119 as pFDFP118 and pFDFP119 (+1 frameshift mutation), pFDFM118 and pFDFM119 (-1 frameshift mutation), pFDFU118 and pFDFU119 (Base substitution mutation). Neither of these mutant plasmids was able to perform lacZ-alpha complementation, so colonies were white on media containing X-Gal and IPTG. PCR product cloning vectors pFDFL118 and pFDFL119 were also constructed. A PCR reaction was carried out using the above-mentioned mutant plasmid as a template, and the reaction product was transformed into E. coli after being ligated with pFDFL118 or pFDFL119. If a back-mutation occurs during the PCR, the transformant is blue on medium containing X-Gal and IPTG. According to the number of blue-white colonies in the transformants, the replication error rate of DNA polymerase can be calculated. Using this system, the error rate of replication of FD DNA thermosensitive polymerase was 10-5 ~ 10-6.
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