【摘 要】
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植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子家族,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在茄子基因组范围内,利用生物信息学方法对茄子AP2/ERF转
【机 构】
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暨南大学生命科学技术学院,广东省农业科学院蔬菜研究所,广东省蔬菜新技术研究重点实验室,暨南大学医学院,
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植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子家族,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在茄子基因组范围内,利用生物信息学方法对茄子AP2/ERF转录因子家族的成员、分布及结构和功能等进行分析。结果表明,茄子AP2/ERF家族包含130个蛋白质,其中AP2、RAV、ERF亚家族分别含有20、2和108个,ERF分为DREB/CBF(41个成员)和ERF(67个成员)两大亚族,进化分析将二者分为11个小亚族。MEME分析表明其含有20个重要基序,相同亚族中的ERF成员蛋白序列的氨基酸保守域构成相似,且各亚族成员的氨基酸保守域组成类似,表明这些基序的存在对ERF蛋白功能的执行是必需的。利用实时荧光定量PCR对茄子38个ERF基因进行组织表达分析,结果表明其存在组织表达差异;胁迫响应分析结果表明,33个基因受ABA、SA、盐、重金属镉、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,可能参与茄子逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为茄子AP2/ERF家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析AP2/ERF基因功能奠定基础。
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