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目的：检测庚型肝炎病毒E2区的基因异质性。方法:通过半巢式逆转录多聚酶链反应检测HGV。对RT-PCR阳性标本直接自动测序或者克隆后测序。结果:通过比较不同时期HGV E2区的核苷酸变化，估计该区每个位点的年突变替换率为3×10-3次。HGV E2区的基因异质性可直接自动测序发现并通过克隆后测序加以证实。该区的基因异质性程度在干扰素治疗后均有下降。结论:基因异质性存在于HGV的E2区，干扰素治疗可减少基因异质性。所测区域是HGV的最不保守序列。