中国部分地区柯萨奇病毒B组5型分子流行病学研究

• 作 者: 姚学君 张雪峰 管书慧 刘秀兰 姜仁杰
• 机 构: 盐城市疾病预防控制中心急传科 224100,江苏省疾病预防控制中心，221000 南京,盐城市疾病预防控制中心急传科 224100,盐城市疾病预防控制中心急传科 224100,盐城市疾病预防控制中心急
• 出 处: 中华实验和临床病毒学杂志
• 发表日期: 2019年33期
• 关键词: 柯萨奇病毒B组5型 VP1 分子流行病学

目的

研究中国部分地区柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5, CV-B5)分离毒株基因特征和遗传进化规律。

方法

利用MEGA6.0软件对GenBank核苷酸数据库收录的分离于中国11个省市CV-B5分离毒株全长VP1区基因序列进行分析，绘制系统进化树，测算分离毒株核苷酸和氨基酸同源性，并计算核苷酸分子进化速率。

结果

纳入中国11个省市CV-B5分离毒株合计189株，主要为基因型C，占分离毒株总数的90.5%。与基因型A相比，中国11个省市CV-B5分离毒株VP1区核苷酸和氨基酸同源性为79.8%～82.8%和92.6%～97.9%，收录中国地区CV-B5分离毒株间核苷酸和氨基酸同源性为80.3%～100.0%和91.5%～100.0%。基因型C分离毒株核苷酸进化速率为4×10^－3/(位点/年)。

结论

中国部分地区CV-B5分离毒株潜在优势流行株为基因型C，又以基因亚型C1和C2共循环流行。