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为了解决深海小型底栖生物样品分离装置的毛细孔堵塞问题,提出了一种适合于其结构和堵塞特点的旋转射流解堵方法.运用计算流体力学(CFD)软件包对分离装置流道进行了建模与仿真,给出了分离装置中毛细孔附近的速度场分布并分析了堵塞原因,比较了高压射流和流式细胞仪的解堵机理.基于上述分析改进了底栖生物分离装置流道样机,结果表明,旋转射流解堵方法具有结构简单、解堵效果好等特点,连续工作未出现堵死情况,是毛细孔解堵的一种有效方法.