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该所由1993年批准成立的农业部蚕桑学重点开放性实验室及2000年成立的重庆市蚕桑学重点实验室发展建成，并在2005年组建教育部蚕学与基因组学重点实验室，2006年组建教育部蚕桑资源与分子改良工程研究中心、商务部西部蚕业科技中心，同年国家外专局、教育部“高等学校学科创新引智计划”批准建设“家蚕系统生物学创新引智基地”。目前，研究所已经发展成为我国蚕桑学基础和应用基础研究、产业技术研发和高级专门人才（硕士、博士）培养的重要基地，是国际著名的蚕桑学研究机构。