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部门预算是与市场经济体制相适应的现代政府预算管理方式，是市场经济国家财政预算管理的基本组织形式。其基本内涵有三点：一是部门作为预算编制的基础单元，取消财政与部门中间环节，财政从基层单位编起。二是财政预算要落实到每一个具体部门，预算管理以部门为依托。改变财政资金按性质归口管理的做法，财政将各类不同性质的财政性资金统一编制到使用这些资金的部门。三是部门本身要有严格的资质要求，限定那些与财政直接发生经费领拨关系的一级预算会计单位为预算部门。因此，部门预算可以说是一个综合预算。