用NMR获取原子间距离约束计算蛋白质三维结构

• 作 者: 林东海 周哲
• 机 构: 厦门大学化学系,厦门大学化学系厦门361005,厦门361005,厦门361005
• 出 处: 波谱学杂志
• 发表日期: 1992年4期
• 关键词: 蛋白 NMR 三维结构 溶液 Protein comformation NMR Algorithm .
• 基金项目: 南京大学配位化学实验室研究基金资助

提出一种以核磁共振(NMR)技术获取蛋白质分子多肽链中原于对(主要是H—H对)的距离约束,来计算蛋白质在溶液中的三维结构的方法。这种方法把肽平面之间的二面角当作独立变量,通过从局部到整体逐渐最优化的方法使适当构造的目标函数最小,计算出这些二面角,以及主链每个残基上六种原子N、H~N、C~α、H~α、C′、O的空间坐标.本方法已编写成计算程序DISNMA,并以碱性胰蛋白酶抑制剂(BPTI)为标准结构,得到了很好的验证.