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来源 :计算机应用与软件 | 被引量 : [!--cite_num--]次 | 上传用户:[!--user--]
【摘 要】
:
随着多数生物基因组测序工作的完成,基因识别就显得尤为重要。CpG岛在基因组中有着重要的生物学意义,而识别CpG岛将有助于基因的识别。因此构建了识别DNA序列中CpG岛的隐马尔可夫模型HMM(Hidden Markov Model),并利用网上人类基因CpG岛数据库中随机选取的94条基因序列数据对该模型进行训练与检测,得到了很高的预测准确率,结果表明HMM用于CpG岛的识别是快速有效的。
【作 者】
:
石鸥燕
杨晶
田心
【机 构】
:
天津医科大学生物医学工程系
【出 处】
:
计算机应用与软件
【发表日期】
:
2008年11期
【关键词】
:
马尔可夫链
隐马尔可夫模型
CPG岛
MATLAB
Markov chain Hidden markov model CpG islands MATLAB
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