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2型糖尿病患者常常合并脂质代谢紊乱，特别是高三酰甘油和高游离脂肪酸血症。这一变化除了会降低组织对胰岛素的敏感性外，对胰岛功能还有潜在的不利影响。一方面，游离脂肪酸可促进胰岛细胞凋亡：另一方面，长期高脂肪酸状态还能影响胰岛素的分泌。这一现象的确切机制不明，但可能有caspase、神经酰胺等信号传导途径的参与，并伴有参与细胞凋亡的基因表达的改变，而线粒体功能的损伤在胰岛细胞凋亡中发挥重要作用。另外，瘦素和过氧化物酶体增生物激活受体(PPAR)也可能在游离脂肪酸的这一毒性作用中占有一席之地。