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马铃薯是重要的茄科作物，在自然界中存在二倍体、三倍体、四倍体、五倍体和六倍体，同时是块茎形成、淀粉合成、对病原物应答研究的模式植物。由于茄科植物基因组存在高度的共线性，为此，开展番茄基因组计划及功能基因组学研究可以为其他蔬菜、水果等重要经济作物的研究提供理论和方法上的直接借鉴。从马铃薯的遗传图谱、物理图谱、序列图谱和转录图谱，以及已从马铃薯中克隆的重要基因等方面详细阐述了马铃薯基因组研究的最新进展。