【摘 要】
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目的探讨基于DNA甲基化状态的亚型在177例头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)样本中的预后价值。方法从TCGA数据库下载HNSCC的甲基化芯片数据、临
【机 构】
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广西医科大学第二附属医院耳鼻咽喉头颈外科
【基金项目】
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广西自然科学基金(2015GXNSFAA414004,2016GXNSFAA380150)。
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目的探讨基于DNA甲基化状态的亚型在177例头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)样本中的预后价值。方法从TCGA数据库下载HNSCC的甲基化芯片数据、临床数据及转录组数据,通过Cox比例风险回归模型筛选出与预后显著相关的甲基化位点,然后利用基因组注释将这些甲基化位点注释为其相对应的基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and ge
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