【摘 要】
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目的通过对皮肤鳞状细胞癌(cSCC)基因表达的数据分析找到异常表达的基因群,明确这些差异基因的功能、参与的信号传导通路,并找出具有标志性功能的枢纽基因,进一步探讨cSCC的
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目的通过对皮肤鳞状细胞癌(cSCC)基因表达的数据分析找到异常表达的基因群,明确这些差异基因的功能、参与的信号传导通路,并找出具有标志性功能的枢纽基因,进一步探讨cSCC的分子机制。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载GSE66359的基因表达数据,对差异基因进行基因本体论(GO)分析和基于京都基因和基因组数据库的通路分析(KEGG通路分析),并应用Cytoscape软件构建差异基因产物的蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选枢纽基因。结果该cSCC基因芯片数据中共有894个差异基因,其中438个上调基因,456个下调基因。GO分析显示上调基因主要富集的生物进程为:有丝分裂细胞周期过程,染色体分离;下调基因:角质形成细胞分化。KEGG分析显示,上调基因主要富集的信号通路:DNA复制、细胞周期;下调基因:MAPK信号通路、Notch信号通路。通过构建PPI网络得到了前10位枢纽基因SHC1、AURKB、SMC4、PLK1、PCNA、PTTG1、BRCA1、MCM2、EphB2、HDAC,这些基因参与3条重要通路,包括细胞周期、DNA复制和蛋白酶体。结论 SHC1、AURKB、SMC4等基因的变异导致染色体、有丝分裂、细胞周期及MAPK、Notch信号通路的异常可能参与cSCC的发生及进展过程。
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