microRNA在树鼩真菌性角膜炎中的调控网络及其生物学功能分析

• 作 者: 贾杰 黎晓慧 黄鑫 李明学 施梅言 邱丹丹 仝品芬 代解杰
• 机 构: 中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所
• 出 处: 陕西师范大学学报:自然科学版
• 发表日期: 2020年5期
• 关键词: 树鼩 真菌性角膜炎 MICRORNA 基因调控网络 tree shrewsfungal keratitismicroRNAgene regulatory net
• 基金项目: 云南省眼科疾病防治研究重点实验室(2017DG008),中央高校基本科研业务费专项资金(3332018162),云南省科技人才和平台计划项目(2017HC019)

筛选树鼩真菌性角膜炎发病过程中差异表达的微小RNA(microRNA,miRNA)和信使RNA(mRNA),分析其靶基因的生物学功能及信号通路,为阐明真菌性角膜炎的免疫机制及筛选其抗真菌治疗的潜在靶点提供线索。通过茄病镰刀菌液显微注射至树鼩角膜基质,诱导真菌性角膜炎的发生;使用高通量测序技术检测茄病镰刀菌感染树鼩第7天、14天和30天的角膜组织miRNA和mRNA表达谱,以自身未感染的眼角膜为对照;差异表达miRNAs的靶基因与差异表达mRNAs取交集构建miRNA-mRNA调控网络,采用实时荧光定量PC