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蛋白质的可逆磷酸化是最重要的翻译后修饰之一,几乎参与生命活动的所有过程。虽然对于磷酸化蛋白的全面解析还存在巨大挑战,质谱已逐渐被人们认为是挑战这一领域的有利工具。质谱技术分析磷酸化蛋白质的方法包括利用抗体免疫沉淀、磷酸化蛋白胶染色、固定化的金属亲和层析柱、化学标签、强阳离子交换等技术富集磷酸化蛋白或肽段,串联质谱、电子俘获分析等技术检测磷酸化肽段并鉴定磷酸化位点,以及同位素标签对蛋白质磷酸化水平进行定量等。