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目的：研究患有消化系统肿瘤的患者进行血清肿瘤标志物检查的临床价值。方法：我院选择2012年9月~2013年9月间诊治的170例消化系统恶性肿瘤患者，作为观察组，并选择同一时期120例健康体检者作为对照组，运用放射免疫分析技术分别检测两组患者的CEA、CA199、CA125以及AFP含量，两组患者差异显著，有统计学意义(P<0.05)。结果：观察组患者血清中的CEA、CA199、CA125以及AFP含量均比对照组高，两组患者差异显著，有统计学意义(P<0.05)。结论：消化系统恶性肿瘤运用多种肿瘤标志物进行联合检测，临床价值显著，能够有效提升恶性肿瘤患者的阳性率，对于术前诊断具有很好的应用价值，值得在临床上推广使用。