鸡miR-181a靶基因的生物信息学分析

• 作 者: 孙桂荣 张虎 康相涛 陈其新 李红 王乐
• 机 构: 河南农业大学牧医工程学院河南省家禽种质资源工程研究中心
• 出 处: 河南农业科学
• 发表日期: 2011年5期
• 关键词: 鸡 miR-181a 通路分析 生物信息学 Chicken miR-181a Pathway analysis Bioinformatics
• 基金项目: 国家自然科学基金项目（31072023）, 国家农业科技成果转化资金项目（2009GB2D000218）, 现代农业产业技术体系建设专项资金（nycytx41g05）

对鸡miR-181a的靶基因进行了预测及相关生物信息学分析,为深入研究miR-181a生物学功能提供理论指导。利用TargetScan 5.1与PicTar 2种计算方法对miR-181a进行靶基因预测,交集的基因集合分别进行GO富集分析和KEGG分析。结果预测到交集靶基因有137个下游靶基因,GO富集分析结果表明,137个靶基因涵盖于生物学过程、细胞组成、分子功能3个分类。KEGG分析结果表明,靶基因富集于神经营养因子信号通路、长时程增强效应通路等与代谢有关的通路。