基于16S rDNA V4与V3-V4可变区高通量测序对浓香型白酒窖泥菌群组成的比较分析

• 作 者: 王艳丽 张会敏 孟雅静 周庆伍 梁金辉 袁志强 刘国英 何宏
• 机 构: 安徽省固态发酵工程技术研究中心
• 出 处: 现代食品科技
• 发表日期: 2020年6期
• 关键词: Illumina高通量测序 窖泥菌群 V4区 V3~V4区 illumina high-throughput sequencingPit-mud microbi

本研究分别对新老窖泥样本的16S rDNA V4和V3-V4区进行Illumina高通量测序,比较了测序的群落多样性参数、NMDS聚类与优势门/属的相对丰度。V4区的OTUs数目(264~639)显著低于V3-V4区(459~1123);V4区的Shannon指数在新、老池壁泥中(2.47、5.02)显著低于V3-V4区(3.33、6.46),而在新(4.98 vs 5.98)、老(5.64 vs 5.39)池底泥样本中无显著差异(p>0.05);V4区的Chao1指数在新池底泥(2455 vs 1