【摘 要】
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目的 探讨培土生金方对慢性阻塞性肺疾病(COPD)的潜在作用机制.方法 本文采用网络药理学和生物信息学方法,首先,从TCMSP、TCMID、TCMDatabase@Taiwan、DrugBank等数据库结合
【机 构】
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广州中医药大学第一临床医学院 广州 510405;广州中医药大学第一附属医院广州 510405;广州中医药大学第一临床医学院 广州 510405;广州中医药大学第一附属医院 广州 510405;深圳市
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目的 探讨培土生金方对慢性阻塞性肺疾病(COPD)的潜在作用机制.方法 本文采用网络药理学和生物信息学方法,首先,从TCMSP、TCMID、TCMDatabase@Taiwan、DrugBank等数据库结合文献报道,获取培土生金方的活性成分及对应的靶点信息,从CTD数据库获取COPD的治疗靶点.结果 获取培土生金方的活性成分83个、潜在的候选靶点193个;接着,通过Cytoscape 3.7.0软件及其NetworkAnalysis插件和String在线分析平台,分别构建活性成分-作用靶点网络图和蛋白质相互作用网络图,整合两者网络拓扑分析的数据,筛选获得潜在的核心靶点77个,排名前10为AKT1、IL6、TP53、VEGFA、JUN、MAPK1、CASP3、TNF、ESR1、NOS3;然后,使用GO和KEGG对靶点进行基因功能和基因通路的注释,富集的信号通路主要涉及PI3K-Akt、MAPK、TNFα、HIF-1、NF-κB、小细胞肺癌和非小细胞肺癌等,其中富集了最多的靶点是PI3K-Akt和MAPK信号通路,分别是31个和28个;同时,借助生物信息学的方法,使用基因表达数据库(GEO)与COPD相关的基因芯片数据集,获得COPD患者与健康人之间的差异表达基因,与网络药理学预测的靶点信息相互验证和比对,得到COPD的潜在靶标.结论 研究表明培土生金方的多个潜在活性成分,可能通过AKT1、IL6、VEGFA、MAPK1、TNF等多个核心靶点在PI3K-Akt、MAPK、TNFα、HIF-1、NF-κB等多个信号通路,起到对COPD的治疗作用,但仍需进一步的动物和细胞实验加以证实.
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