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采用分子对接软件AutoDock分别研究了金属核酸酶、寡聚酰胺与DNA对接模式．研究结果表明，金属核酸酶、寡聚酰胺与DNA对接结果与实验数据吻合得较好．在金属核酸酶与DNA的对接中，最优构型都是金属核酸酶对接在DNA的小沟内．随着中心金属上电荷的增加，最大对接能呈现上升趋势．尤其是配体体积较小的金属核酸酶，最佳对接位点受中心金属上电荷影响较大，即随着中心金属上电荷的从少到多，最佳对接位点呈现多样化的趋势．在柔性分子寡聚酰胺与双链DNA分子的对接中，分子随DNA小沟的柔性变形是对接结合的关键．其最佳的结合物