灰盖鬼伞基因组中微卫星序列的组成

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本研究利用已公布的灰盖鬼伞基因组测序结果,对该真菌基因组中的微卫星(microsatellite)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)进行了系统分析。结果表明.在已公布的36.2Mb的基因组序列中,共有7859个SSR序列(长度大于15bp,匹配值大于80%)。SSR的碱基总数达143kh,约占整个基因组碱基数的0.40%,平均4.61kh中就有1个大于15bp的SSR序列。其中数量最多的是3碱基SSR,数量达到3033个。其次为6碱基重复序列(2121个)、5碱基重
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