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化龙山种子植物区系的地理成分复杂，联系广泛，温带成分为主（有４２８属，占６０．６２％），热带成分次之（有２３５属，占３３．２８％），具有明显的暖温带向亚热带过渡特征。本区集中了丰富的中国特有成分及大量原始的温带属和众多的古老孑遗植物，是我国第三纪植物区系的重要“避难所”。区系地理成分的比较分析表明，化龙山应位于华中植物区系的边缘地带，很可能是东亚植物区系东西两大植物亚区的交汇地。