【摘 要】
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目的 研究炎症因子IL-6缺失是否影响鼻咽部菌群组成.方法 提取鼻咽部灌洗液DNA并进行扩增子测序检测IL-6敲除前后鼻咽部菌群,分析菌群α多样性,并使用Wilcoxon秩和检验分析差
【机 构】
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中国医学科学院医学生物学研究所,中国医学科学院病毒疫苗研发系统创新研究重点实验室,云南昆明 650118
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目的 研究炎症因子IL-6缺失是否影响鼻咽部菌群组成.方法 提取鼻咽部灌洗液DNA并进行扩增子测序检测IL-6敲除前后鼻咽部菌群,分析菌群α多样性,并使用Wilcoxon秩和检验分析差异菌群.通过PICRUSt对菌群OTU丰富度表进行标准化,然后进行菌群关联的KEGG分析.结果 IL-6基因敲除后鼻咽部菌群丰富度和多样性变化不明显,但菌群组成发生明显变化.丰富度前15个属中9个属明显变化,有6个属明显下降,3个属明显上升.其中,Streptococcus和Bergeyella丰富度明显升高,Staphylococcus、Rothia和Corynebacterium_1丰富度明显降低.Real time PCR检测种水平发现IL-6敲除后Staphylococcus lentus丰富度明显降低.菌群KEGG分析发现,IL-6敲除后,炎性功能相关的脂肪细胞因子信号通路表达下调、细胞凋亡通路表达上调,另外,部分抗病毒活性通路表达上调.结论 炎性因子IL-6与鼻咽部菌群组成存在明显相关性,菌群KEGG分析发现IL-6敲除后多个炎性功能相关通路表达受到影响.
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