【摘 要】
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目的通过高通量测序结合生物信息学分析，预测110株志贺菌属中与耐药基因库序列相似度差异较大的潜在新型耐药基因。方法110株志贺菌属来源于2006年6月-2011年6月温州地区不同
【基金项目】
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浙江省自然科学基金资助项目(Y2110204);温州市科技计划基金项目(H20110009);浙江省大学生科技创新活动计划基金资助项目(2012R413060)
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目的通过高通量测序结合生物信息学分析，预测110株志贺菌属中与耐药基因库序列相似度差异较大的潜在新型耐药基因。方法110株志贺菌属来源于2006年6月-2011年6月温州地区不同医院腹泻患者粪便标本，采用碱裂解法提取志贺菌属的混合基因DNA，IlluminaHiSeq2000高通量测序；通过基于同源比对核心算法的基因分析，挖掘与已知耐药基因遗传变异较大、相似性较低的潜在新型耐药基因。结果110株志贺菌属中福氏志贺菌30株、宋氏志贺菌80株，福氏、宋氏志贺菌高通量测序总碱基数分别为4．9和3．5Gb；志贺菌
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