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高空气象观测是气象基础业务之一，为天气预报、气候分析、科学研究和国际交换提供准确、及时的高空气象资料，所以在现阶段的人民生活中占有重要地位，但由于多方面因素导致特殊问题也时有存在，这就需要完善针对不同问题的应急处理。基于此，本文就在高空气象观测中的特殊情况以及应急处理方式展开讨论，旨在为进一步完善高空气象观测模式提供参考，从而提升行业的科学性、综合应急处理能力和气象服务能力。