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采用SSCP方法对523头牛线粒体DNA的D-loop序列和12SrRNA基因序列进行多态性研究，再结合DNA直接测序技术发现D-loop序列的SSCP结果与直接测序结果不相符，而12SrRNA的SSCP检测结果与测序结果相同，结果发现对于高变异率片段如线粒体DNAD-loop片段，不适合用SSCP方法进行多态分析；而对于比较保守的片段，如12SrRNA片段适合用SSCP进行多态性分析。