【摘 要】
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为了科学准确地划分现有民猪保种群体的亲缘关系及家系结构,试验采用猪的“中芯一号”育种芯片检测了70头民猪的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP);使用MEGAX(V10.0)和R软件进行公畜样本及全部样本的聚类分析,使用Plink (V1.90)和R软件等进行近交系数的计算及因果突变分析,并统计分析影响猪的肉质性状、生长和体型性状、繁殖性状和抗病性性状等11个基因的基因型.结果 表明:民猪保种群内的20头公猪可划分为5个血统,49头母猪可分别划入这5个血统,
【机 构】
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黑龙江省农业科学院畜牧研究所,哈尔滨150086;农业农村部种养结合重点实验室,哈尔滨150086;黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院,黑龙江齐齐哈尔161005;黑龙江东北虎林园中国横道河子猫科动物饲养
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为了科学准确地划分现有民猪保种群体的亲缘关系及家系结构,试验采用猪的“中芯一号”育种芯片检测了70头民猪的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP);使用MEGAX(V10.0)和R软件进行公畜样本及全部样本的聚类分析,使用Plink (V1.90)和R软件等进行近交系数的计算及因果突变分析,并统计分析影响猪的肉质性状、生长和体型性状、繁殖性状和抗病性性状等11个基因的基因型.结果 表明:民猪保种群内的20头公猪可划分为5个血统,49头母猪可分别划入这5个血统,但有1头个体与这5个血统均不存在亲缘关系,而被归为“其他”.群体平均近交系数为0.11,属于中度近交.在因果突变分析中,该群体内氟烷基因和酸肉基因还未得到净化;采食量、抗仔猪腹泻和料肉比的优势等位基因占比较高,但影响多肋骨数和多胸椎数的优势等位基因占比非常低,还有较大的选择空间.说明未来该民猪保种群体要尽量避免近交,考虑引入新的公猪血统,尽快剔除携带有劣势基因型的个体,提升种群的生产性能.
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