低温胁迫对意大利蜜蜂化蛹时差异可变剪接基因的影响

• 作 者: 姚丹 徐新建 周姝婧 周冰峰 朱翔杰
• 机 构: 福建农林大学动物科学学院（蜂学学院）
• 出 处: 福建农林大学学报:自然科学版
• 发表日期: 2020年2期
• 关键词: 低温 意大利蜜蜂 可变剪接 发育 low temperatureApis mellifera ligusticaalternative splicingdeve
• 基金项目: 现代农业蜂产业技术体系建设专项资金项目(CARS 45 KXJ11),福建省自然科学基金资助项目(2016J01699).

基于前期低温胁迫3日龄封盖子不同时间的转录组数据,对可变剪接基因(ASG)作数量、种类统计和表达谱等分析,进一步解释低温对蜜蜂化蛹影响的分子机制;同时利用rMATS软件及Omicshare在线工具对T18、T36处理组(在20℃低温下分别处理18和36 h)及CK(没有低温处理)的差异基因进行可变剪接(AS)事件分析.结果表明,在各组别(CK与T18、CK与T36、T18与T36)中鉴定出4 971个ASG,产生58 017个AS事件,以外显子跳跃、外显子选择性跳跃和可变3′端剪接3种剪接类型为主.各组别