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以光裸星虫为试验材料,通过单因素方法对影响其ISSR-PCR扩增效果的因子（模板DNA、Mg2＋、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶、甲酰胺和二甲基亚砜）浓度进行研究。确立适合光裸星虫ISSR-PCR的反应体系：25μL体积含1×PCR buff-er、模板DNA用量为10-50 ng、TaqDNA聚合酶为0.75-1.75 U、Mg2＋浓度为1.5-2.5 mmol/L、dNTP浓度为0.20 mmol/L,引物浓度为0.8-1.2μmol/L,甲酰胺和二甲基亚砜的添加并不能优化光裸星虫IS