先天性心脏病致病基因斑马鱼直系同源基因的鉴定及表达分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:week11430
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先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)较高的发病率(0.69%~0.93%)和致死率是儿童致残和致死的首要原因.虽然环境危险因素涉及,但流行病学研究证明遗传因素是CHD的主要病因.临床上,将CHD分为综合征先心病(Syndromic CHD)和单纯性先心脏(Isolated CHD).尽管不同脊椎动物心脏腔室数目不同,但是心脏发育的过程和调控的机制具有保守性.斑马鱼胚胎体外发育且透明,内部器官清晰可见,非常适合用于心脏早期发育机制和CHD致病机理的研究.本研究总结了97个人类CHD致病基因,鉴定了其在小鼠和斑马鱼中的直系同源基因,并比较了基因在蛋白水平上的序列相似性.利用Tg (myl7: EGFP)标记斑马鱼心脏的鱼系,收集24 hpf (Hour post fertilization)、30 hpf、36 hpf和48 hpf胚胎期心脏和24 hpf身体(除心脏外的整个鱼体)作为对照,样品利用Illumina平台进行转录组基因表达分析.在93个CHD致病基因斑马鱼直系同源基因中,相对于身体,约50%的基因在心脏早期发育过程中显著上调表达.本研究对CHD疾病遗传诊断和利用斑马鱼疾病模型研究CHD发病机制研究具有重要的理论意义和实践价值.
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