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从64对EcoRI／MseI引物（其中Msel引物为荧光标记物）中筛选出7对扩增产物多态性高、谱带清晰的引物，对来自山东的29个古银杏种质的遗传关系及特异种质进行了研究。结果表明：7对引物共产生1003条谱带，138个特异位点（其中缺失带36条、单态带102条），多态带915条，多态带的比例为91．21％；每对引物鉴别效率为100％。29个古银杏种质之间相似系数为0．43～0．84，来自不同地区的银杏种质遗传变异程度不同。当相似系数为0．71时，供试种质可分为四类，古银杏种质的聚类与地理位置的远近并不完全