【摘 要】
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目的 对青海省1株经传统方法初步鉴定为福氏志贺氏菌的分离株(GH24)从16S rRNA基因水平做进一步分类与鉴定.方法 采用PCR方法扩增菌株GH24的16S rRNA基因并测序,将所得序列在
【机 构】
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青海省疾病预防控制中心检验检测中心细菌科,青海西宁,810007
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目的 对青海省1株经传统方法初步鉴定为福氏志贺氏菌的分离株(GH24)从16S rRNA基因水平做进一步分类与鉴定.方法 采用PCR方法扩增菌株GH24的16S rRNA基因并测序,将所得序列在GenBank、MicroSEQ ID和RDP数据库中进行同源性分析;利用ClustalX 1.83和Mega 5.0软件分析GH24与志贺氏菌属代表菌株间的进化关系.结果 GH24的16S rRNA基因序列长度为1 453 bp,在GenBank中与志贺氏菌属细菌同源性最高,为99%;在MicroSEQ ID和RDP数据库中与福氏志贺菌的同源性最高,为99.91%和100%.与志贺氏菌属代表菌株的多序列比较,GH24与福氏志贺氏菌的同源性为99.7%~99.4%,与其他志贺氏菌的同源性为99.2%~96.7%.系统发生树显示,GH24与福氏志贺氏菌属于同一进化分支.结论 运用16S rRNA基因序列分析鉴定分离株GH24为福氏志贺菌.该方法快速,结果可靠.
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