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采用非参数的DEA—malmqusit指数方法对我国2006-2011年农产品物流生产效率进行了测算。结果表明:我国农产品物流全要素生产率实现了3%的增长,其中西部地区高于东部地区和中部地区;技术进步实现了4.6%的增长,纯技术效率实现了1.7%的增长,其他分解因素没有增长。从农产品物流体系、国家政策、农产品物流资金投入及技术创新等方面提出建议,为我国农产品物流生产效率的提升提供参考。