RNA Editing Sites Exist in Protein-coding Genes in the Chloroplast Genome of Cycas taitungensis

来源 :植物学报(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:vkw74
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
RNA editing is a post-transcriptional process that results in modifications of ribonucleotides at specific locations.In land plants editing can occur in both mitochondria and chloroplasts and most commonly involves C-to-U changes,especially in seed plants.Using prediction and experimental determination,we investigated RNA editing in 40 protein-coding genes from the chloroplast genome of Cycas taitungensis.A total of 85 editing sites were identified in 25 transcripts.Comparison analysis of the published editotypes of these 25 transcripts in eight species showed that RNA editing events gradually disappear during plant evolution.The editing in the first and third codon position disappeared quicker than that in the second codon position,ndh genes have the highest editing frequency while serine and proline codons were more frequently edited than the codons of other amino acids.These results imply that retained RNA editing sites have imbalanced distribution in genes and most of them may function by changing protein structure or interaction.Mitochondrion protein-coding genes have three times the editing sites compared with chloroplast genes of Cycas,most likely due to slower evolution speed.
其他文献
目的观察不同直径和不同打击力度的圆柱形木棒对垂直方向打击皮肤所形成的中空性皮下出血形态的相关性。方法采用生物力学击打装置,使用5种不同直径(2.0~4.0cm)木棒,从零递增
目的 调查Qiagen Investigator(R) DIPplex试剂盒30个InDels多态性位点在中国汉族、藏族、维吾尔族人群中的群体遗传学数据,评估其法医学应用价值.方法 采集汉、藏、维吾尔族
基于扩展规则的定理证明方法是一种与归结方法互补的新的定理证明方法,首先通过对扩展规则的深入研究,给出了扩展规则的一个重要性质,设计并实现了该性质的判定算法.此外,从
用线性化近似方法计算了噪声间关联程度λ受时间周期调制下单模激光系统的光强关联时间T,结果表明,无论λ=0,λ>0或λ
在人工侧向冻结、正弦和恒温2种冻结温度、开放和封闭条件下,对含水率为32 %的重塑粉质黏土进行了4组冻结试验.结果表明,补水条件相同时侧向正弦冻结试样的冻结速度比封闭正
在分析郑西客运专线试验段路基沉降实测资料的基础上,提出沉降变形常规预测方法受观测时间及单次观测结果的影响比较大,不利于用来预测最终沉降.通过分析现场沉降变形与时间
以系统运行的经济性和可靠性为目标,提出了一种抽水蓄能电站的综合规划模型。该模型不仅考虑了系统需求约束、备用约束以及电站静态运行约束,而且考虑了能源约束、环保约束以
因为运动特征数据的高维复杂性,采用非线性的Isomap流形学习的降维算法来对运动特征数据进行降维,为了能让Isomap方法处理训练数据集之外的数据,通过学习主成分特征核函数逼
激光跟踪仪采用单站极坐标测量原理,将高精度激光测距技术和经纬仪精密测角技术相结合,实现大尺寸(50 m)空间三维坐标点的高精度测量.激光跟踪仪采用的增量式测角圆光栅是一
为降低可扩展标记数据查询执行器重新构建的代价,提出了一种基于树型结构的可扩展标记语言查询增量维护算法.该算法利用树型结构进行可扩展标记语言数据流查询执行器增量维护